Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms