Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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Znf608Q56A10 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf608Q56A10 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms