Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms