Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms