Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nxf2Q4ZGD8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms