Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms