Protein–RNA interactions for Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88bQ4QRL3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88bQ4QRL3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms