Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms