Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms