Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Esf1Q3V1V3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Esf1Q3V1V3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms