Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc110Q3V125 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms