Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms