Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9Q3V038 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms