Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed1Q3V009 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed1Q3V009 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms