Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcsd1Q3UZA1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcsd1Q3UZA1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms