Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms