Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms