Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms