Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxred2Q3USW5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxred2Q3USW5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms