Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B230104I21RikQ3USW4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms