Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms