Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms