Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CrxosQ3UL53 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CrxosQ3UL53 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxosQ3UL53 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms