Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b2Q3UJB0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms