Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms