Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mier3Q3UHF3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms