Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf166Q3U9F6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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