Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Gtpbp6Q3U6U5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gtpbp6Q3U6U5 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gtpbp6Q3U6U5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms