Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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