Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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