Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hvcn1Q3U2S8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hvcn1Q3U2S8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hvcn1Q3U2S8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hvcn1Q3U2S8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hvcn1Q3U2S8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hvcn1Q3U2S8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hvcn1Q3U2S8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hvcn1Q3U2S8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hvcn1Q3U2S8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hvcn1Q3U2S8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms