Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms