Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms