Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Palb2Q3U0P1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms