Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms