Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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