Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxw18Q3TSA9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms