Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc4Q3TR08 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms