Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms