Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca4Q3TKT4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca4Q3TKT4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms