Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms