Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RubcnlQ3TD16 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RubcnlQ3TD16 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms