Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc127Q3TC33 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms