Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1aQ2LKU9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms