Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd11Q1RNF8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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