Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms