Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cers3Q1A3B0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms