Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms