Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd9Q14BI7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Tdrd9Q14BI7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Tdrd9Q14BI7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Tdrd9Q14BI7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Tdrd9Q14BI7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Tdrd9Q14BI7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd9Q14BI7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms