Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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